《天下雜誌》總主筆何榮幸表示，吹哨者促成許多調查報導的出現，但國家現今法律仍無法有效保護吹哨者安全。
何榮幸以自身參與過的調查報導為例，分享吹哨者與調查報導間的關係。吹哨者提供的資訊促成許多調查報導的出現，《聯合報》的「公共建設案」系列報導便是當時客委會主委羅文嘉所提供的內部消息。調查報導若在適當的時間出現，就可以改變政策，減少不必要的公共支出。
何榮幸表示，吹哨者在揭密之後，會付出不同程度的代價，現身的吹哨者終身被貼標籤，未現身者則度日如年，也會面臨解職或人身安全威脅，不利的處境使得願意揭秘的人少之又少，也正因如此，政府更須提供完善保護。
除了爆料者外，報導的媒體也同樣會遭遇威脅。《天下雜誌》在做調查報導的過程中，也曾面對被抽廣告的懲罰，而參與的調查記者也同樣會有安全威脅。吹哨者有時僅提供基本資訊，但調查的過程成為媒體須負擔的責任，媒體必須設法採集證據，還原現場。此外，接獲爆料的媒體，也必須確定資訊來源的真實性，蒐證與可信度，成為調查報導的關鍵。
很多時候，吹哨者的爆料都是違反保密條款的，但為了能揭密不法，政府也必須給予這些吹哨者更完整的保護行動。目前許多國家對於吹哨者的保護已經完善，而台灣在一連串食安事件後，也曾大幅討論吹哨者的揭弊保護機制，可惜僅停留在食安問題上，國家安全議題的範疇上仍未獲得保障。
調查報導雖然無法立即改變政策或阻止不法，但還是能夠適時發揮影響力。除了施加政府壓力外，也可以引起社會大眾的討論，以輿論壓力迫使政府正視問題。
地方公民媒體崛起
公民記者在台灣仍面臨許多困境，在地公民媒體的出現，能串連起各地公民記者的力量，提升在地媒體的重要性。
台灣和平草根聯盟理事長莊豐嘉表示，希望建立起各縣市的公民記者新聞平台。而這些獨立運作的媒體平台，也可以經由串連、共享資源的方式，降低營運成本，增加在地媒體的能見度。由完整訓練的公民記者經營地方新聞，不但能發展出自身特色，也可以解決公民新聞素質不齊的問題。
現在主流媒體的報導方向有往台北集中的趨勢，地方議題在大眾媒體很難被關注，也因此莊豐嘉希望可以經由散布在台灣各地的地方公民記者，查訪及報導被主流媒體忽略的地方議題。莊豐嘉表示，地方公民媒體不但更加靈活，也可以在地報導，提供完整消息。透過串連力量與各地公民記者的訓練，達到低成本、高品質的跨區域合作。以近年食安危機為例，莊豐嘉希望可以結合不同縣市的公民記者，撰寫各地食安新聞，彌補大眾媒體在調查報導上的限制。
風起負責人林駿騰則以自身在農村工作的經歷，分享創辦《風起》的過程。他認為，「只有語言強勢的人才有發言權，非漢族居民的聲音在社會上無法被聽見，社會大眾也無法感受到他們的處境」。也因此，《風起》注重語言對資訊傳遞的影響，嘗試加入部分原住民語言，改變以漢字閱讀的習慣。
《風起》將自己定位成共同創作、共同編輯的在地媒體，也強調編輯與在地的關係，希望可以透過進駐在地，接觸大眾媒體所未能觸及地方文化。此外，《風起》也希望可以連結新竹在地文化與社會，透過地方記者撰寫文稿，建立起《風起》與社區的網絡，替在地議題發聲。不過，如同許多在地媒體都在起步的階段，《風起》也面臨各種資金、經營的困境，以及自身定位的矛盾。
台灣公民媒體仍在發展階段，但都希望在即時新聞當道的媒體環境裡，嘗試加入更多有溫度的報導內容，報導詳實但又不失批判性的在地新聞。
